迷你麝香龜，作為一種和普通麝香龜（密西西比麝香）龜即沒區(qū)分出亞種的龜，它的背甲腹甲包括花紋是基本類似的，不會把它和其它種的龜搞混，這就象北種烏龜E和南種烏龜E，盡管沒有區(qū)分亞種，但是兩個一眼就能看出來不同。

迷你麝香的主要特征是在個體上：公龜成體在5－6CM，母龜成體在7－8CM，公龜看看瀉殖腔那里，母龜看腹甲之間的分隔，很容易區(qū)別出它和普通麝香來，小苗的話迷你麝香的小苗比普通麝香的小一些。

第二個特征就是體型，成體迷你麝香龜不論公母，都感覺前窄后寬，普通麝香這個區(qū)別不明顯，第三個特征是背甲的顏色，迷你麝香成體色深，基本是黑色，而普通麝香會淡的多。這兩個特征不是很明顯，還是直接看腹甲明顯的多。