劉裕掌權(quán)

402年司馬元顯為了避免桓玄乘亂偷襲，搶先西征，任劉牢之為先鋒，司馬尚之為后部?；感猜受姈|下，最后大破司馬尚之。劉牢之認(rèn)為司馬元顯無用，倒戈引桓軍入建康。桓玄控制朝廷，誅殺異己，先后殺司馬元顯與道子，并奪取劉牢之兵權(quán)，誅戮部分北府將領(lǐng)，提拔北府將領(lǐng)劉裕。他最初有意革新朝廷，但最后豪奢縱欲，政令無常，漸失人心。403年桓玄篡位稱帝，建國桓楚。隔年劉裕同北府舊將何無忌、劉毅舉兵，收復(fù)建康，桓玄挾晉安帝西撤江陵。不久桓玄又率軍東下，被劉毅擊敗，在逃往蜀地途中被馮遷所殺。而后桓振、桓謙又挾晉安帝反抗，劉裕直到405年肅清桓氏勢力，得以迎晉安帝復(fù)位，掌控了朝廷。

劉裕掌控朝廷后，荊州刺史劉毅忌妒，意圖舉兵。412年劉裕搶先討伐劉毅，劉毅兵敗自殺。405年，益州刺史毛璩率軍討伐江陵桓振，蜀軍不愿遠(yuǎn)征，推譙縱為首叛晉，譙蜀建立。蜀軍隨后攻陷成都，殺死毛璩，譙縱自號成都王。408年晉廷派劉敬宣率軍討伐但失敗。413年劉裕派西陵太守朱齡石率軍西伐，攻占成都。譙縱敗退自殺，譙蜀亡。

盧循為孫恩繼承人，桓玄為安撫他任為永嘉太守，但他仍不斷襲擾沿海。404年盧循由海路攻占廣州，隔年晉廷又任命他為廣州刺史。410年盧循趁劉裕北伐南燕之機(jī)，與其姐夫徐道覆分二路北伐，于桑洛州合力擊潰劉毅（今江西九江市），乘勢攻入京師建康，史稱盧循之亂。此時劉裕回撤，盧循和徐道覆發(fā)生內(nèi)訌，盧循久攻京師不破，撤守尋陽。10月徐道覆進(jìn)攻江陵，為守將劉道規(guī)所敗。12月盧循被晉軍打敗，退守廣州。411年劉裕派兵擊殺徐道覆。盧循最后于交州被交州刺史杜慧度殲滅，投水自殺，至此亂事平定。

劉裕稱帝

劉裕消滅若干異己后，先后發(fā)動兩次北伐。當(dāng)時南燕慕容超屢屢入侵，409年劉裕率軍伐南燕，次年攻破南燕都城廣固（今山東青州市），擒殺慕容超，南燕亡。而后因盧循叛亂，劉?；貛?。后秦屢遭胡夏帝赫連勃勃入侵，國勢大衰，幼主姚泓初立。416年12月劉裕再度北伐，連克許昌、洛陽。隔年劉裕兵分兩路圍攻關(guān)中，最后攻破長安，后秦亡。但該年冬天，留守京師的劉穆之突然去世，為免后方生變影響自己的篡晉計(jì)劃，劉裕不得不返回京師。他命其幼子劉義真同王鎮(zhèn)惡、沈田子諸將防守長安，后來諸將內(nèi)訌，胡夏帝赫連勃勃率軍攻擊。417年冬劉裕命劉義真等率軍東歸，遭夏軍追擊，元?dú)獯髠?，至此北伐結(jié)束。長安雖得而復(fù)失，良將勁兵損失頗多，但收復(fù)之地并未損失多少，潼關(guān)以東收復(fù)的部分關(guān)中之地和整個河南地區(qū)仍然得到劉裕的重兵扼守。經(jīng)過兩次北伐，黃河以南、淮水以北以及漢水上游的大片地區(qū)，為劉裕據(jù)有。同年劉裕殺晉安帝，立其弟德文，為晉恭帝。420年劉裕廢晉恭帝自立，是為宋武帝，建國宋，史稱南朝宋，東晉至此滅亡，進(jìn)入“南北朝時期”。此時北方仍處于五胡十六國時期，直至440年北魏統(tǒng)一后方形成南北朝對峙格局。